Le Pygargue à tête blanche est une espèce peu commune mais répandue au Canada, les concentrations les plus élevées se trouvant sur la côte ouest. Après avoir connu d'importantes diminutions durant la première moitié du 20e siècle, la population a connu une augmentation importante depuis le début des années 1970 selon les données du Relevé des oiseaux nicheurs et du Recensement des oiseaux de Noël. Le rétablissement de la population semble être lié à la réduction des menaces provenant de la persécution par l'homme et de l'utilisation de pesticides (Buelher 2000). En 1984, le Pygargue à tête blanche a été désigné non en péril au Canada par le Comité sur la situation des espèces en péril au Canada (COSEPAC). Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
Le Pygargue à tête blanche, l'un des exemples de réussite en matière de conservation sur le continent, se rétablit des baisses d'effectifs importantes liées à la persécution par l'homme et à l'utilisation de pesticides au 20e siècle (Buelher 2000). À l'heure actuelle, la menace principale pesant sur l'habitat de l'espèce est l'aménagement des milieux côtiers et riverains, qui modifie et perturbe les habitats de nidification, d'alimentation et de repos privilégiés par l'espèce (Buelher 2000). Cependant, les Pygargues à tête blanche prolifèrent, notamment en raison de leur capacité d'adaptation à des paysages dominés par l'homme (Guinn 2013).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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