Au Canada, les Moucherolles tchébecs nichent dans des territoires groupés depuis le Yukon et les Territoires du Nord-Ouest jusqu’à la frontière avec les États-Unis et vers l’est jusqu'à Terre-Neuve. Les résultats du Relevé des oiseaux nicheurs indiquent que la population canadienne a connu une baisse de 54 % par rapport au début des années 1970. La responsabilité du Canada quant à la conservation cette espèce est très élevée, car on estime que le pays abrite 88 % de la population nicheuse mondiale. Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
Les Moucherolles tchébecs, qui se nourrissent principalement d’insectes en vol, présentent habituellement des concentrations corporelles de pesticides plus élevées que celles trouvées chez les frugivores et les granivores (Tarof et Briskie 2008). Cette espèce semble également sensible aux perturbations découlant des activités d'exploitation forestière, à la dégradation de la forêt par les pluies acides, à la perte de végétation de sous-étage liée à la succession naturelle, et au broutage excessif exercé par le cerf de Virginie (Tarof et Briskie 2008).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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