Le Moucherolle phébi est l'un des premiers oiseaux migrateurs à apparaître au début du printemps au Canada. Cette espèce est abondante et répandue. Les résultats du Relevé des oiseaux nicheurs indiquent que taille de la population a légèrement diminué, mais qu'elle est semblable à celle du début des années 1970. Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
Le Moucherolle phébi est un oiseau migrateur du début du printemps; il est vulnérable aux conditions météorologiques peu clémentes à cette période de l'année. En outre, une proportion importante de la population nicheuse hiverne dans le sud des États-Unis, où elle peut également être exposée à des conditions météorologiques difficiles (Weeks 2011). On pense que l'utilisation de structures d'origine anthropique comme sites de nidification a profité à l'espèce, lui permettant d'élargir son aire de répartition aux prairies. Cela signifie toutefois que certains individus peuvent désormais dépendre de ces structures. Or ces structures favorables, comme les ponts et les ponceaux, sont de plus en plus remplacées par des matériaux moins favorables, et la diminution du nombre de sites de nidification convenables pourrait avoir une incidence négative sur la population (Weeks 2011, McNair 2016).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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