La Mouette tridactyle se reproduit en colonie sur des falaises maritimes. Au Canada, les colonies de nidification se concentrent dans le golfe du Saint-Laurent, dans les eaux environnant Terre-Neuve et dans l’Extrême-Arctique. Les tendances d’effectif varient d'une colonie à l'autre et d'une région à l'autre, mais dans l'ensemble, la population canadienne a connu peu de changement par rapport à environ 1970. Comme les oiseaux se nourrissent à la surface de l'eau ou à proximité de celle-ci, l'espèce est très vulnérable aux modifications d'origine humaine ou climatique de la disponibilité de proies. Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
Les modifications de la disponibilité de proies ont eu un fort impact sur la Mouette tridactyle. Le réchauffement des écosystèmes marins dans l’Arctique européen y a probablement fait que le régime alimentaire de la Mouette tridactyle est passé d’espèces proies essentiellement arctiques à un mélange d’espèces comprenant une forte proportion d’espèces atlantiques (Vihtakari et al. 2018). Les modifications de disponibilité des diverses espèces proies ou des pratiques de pêche peuvent réduire le succès reproductif des Mouettes tridactyles (Hatch et al. 2009). On pense que les baisses d’effectif observées à l’échelle de l’aire de répartition de l’espèce dans les années 1990 sont associés à un bouleversement en cascade du réseau trophique marin causé par le réchauffement abrupte des océans durant cette période; les modifications des communautés planctoniques ont entraîné des changements de la disponibilité de poissons de petite taille, proies préférées de cet oiseau (Descamps et al. 2017). Cela pourrait avoir affecté les Mouettes tridactyles en réduisant la disponibilité de nourriture et en accroissant la prédation par les goélands, laquelle se trouve accentuée quand les populations de petits poissons sont faibles (Massaro et al. 2001, Descamps et al. 2017).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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