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Le Cormoran à aigrettes est le cormoran le plus abondant au Canada. Il se reproduit généralement sur des îles en mer et d'eau douce. Divers relevés démontrent clairement que les Cormorans à aigrettes ont connu une croissance importante au Canada depuis le milieu des années 1970; à certains emplacements, cette croissance a été spectaculaire et a été suivie par l'établissement de nouvelles colonies de nidification. Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
En raison des augmentations substantielles de l'abondance chez les cormorans au cours des dernières décennies, la plupart des problèmes liés à la gestion concernent les conflits avec l'homme et la dégradation de l'habitat. Les Cormorans à aigrettes sont jugés nuisibles à la pêche par quelques adeptes de la pêche sportive et ceux de la pêche commerciale. Les cormorans se nourrissent de façon opportuniste de poissons, mais les espèces de pêche récréative ou sportive ne constituent pas une part importante de leur alimentation (Dorr et al. 2014). Des méthodes létales ou non létales sont couramment employées pour empêcher les cormorans de se nourrir des poissons dans les installations aquacoles (Dorr et al. 2014). Les emplacements où se trouvent les colonies de nidification sont rapidement dépouillés de la végétation ce qui limite les possibilités des autres oiseaux nicheurs de s'y établir (Bedard et al. 1997).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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