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Plus de 80 % de l'aire de reproduction de cette espèce se trouve au Canada, dans les provinces des Prairies, principalement dans les grands marais d'eau douce où domine la massette, dans les prairies et les plaines boréales (Beyersbergen et al. 2009). Le suivi des populations de la Mouette de Franklin est difficile, parce que les colonies ont tendance à se déplacer en fonction des niveaux d'eau et elles sont souvent difficiles d'accès. Les résultats du Relevé des oiseaux nicheurs semblent indiquer une baisse importante depuis les années 1970, bien que la fiabilité de cette évaluation soit faible. Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
La Mouette de Franklin dépend fortement des milieux humides des prairies pour sa reproduction. De plus, elle a besoin de roseaux convenables pour construire des nids flottants, habituellement dans des eaux dont la profondeur va de 37 à 125 cm (Beyersbergen et al. 2009). Les facteurs de stress supplémentaires incluent les collisions avec des lignes électriques, les nids inondés à cause de l'élévation des niveaux d'eau et la dégradation de l'habitat due à des activités récréatives et à l'aménagement des berges. Bien qu'auparavant l'espèce ait été menacée par la perte à grande échelle de son habitat en raison du drainage des terres humides des prairies, la remise en état et la reconstitution de ces terres semblent atténuer les pertes passées (Burger et Gochfeld 2009).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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