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Le Grèbe à cou noir, le plus abondant des grèbes, se reproduit dans les lacs peu profonds et les étangs de l'ensemble des provinces de l'ouest du Canada (Cullen et al. 1999). Les données du Recensement des oiseaux de Noël indiquent une tendance légèrement négative dans toute l'Amérique du Nord, tandis que des relevés aériens depuis le milieu des années 1900 des principales haltes migratoires d'automne aux États-Unis varient entre des diminutions et peu de changement. La situation propre à la portion canadienne de la population demeure incertaine, mais on pense qu’elle a peu changé depuis 1970. Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
Le regroupement en grandes bandes du Grèbe à cou noir tout au long de l'année rend ces oiseaux vulnérables aux phénomènes stochastiques, toutefois les menaces propres à l'espèce restent largement inconnues. Les collisions et les atterrissements en masse au sein de rassemblements denses d'oiseaux migrateurs attirés par la lumière peuvent s'avérer des causes importantes de mortalité et d'épidémies, tandis que le manque de nourriture ou les fluctuations météorologiques peuvent également causer la mort de façon soudaine et spectaculaire (Cullen et al. 1999). La perte des habitats en milieux humides causée par le développement agricole et la perturbation des aires de reproduction en raison d'activités récréatives réduiront probablement davantage la nidification (Cullen et al. 1999).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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