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Le Moqueur roux est un habitant bien visible des bordures de forêts frutescentes à feuilles caduques et des clairières le long de l'extrémité sud du Canada. Le Relevé des oiseaux nicheurs laisse entendre qu'il y a un déclin modéré du nombre d'individus depuis environ 1970. On pense que la perte et la dégradation de l'habitat constituent les raisons les plus importantes de ce déclin (Cavitt et Haas 2000). Cette espèce a été identifiée comme étant une priorité de conservation et/ou d’intendance dans une ou plusieurs stratégies régionales de conservation des oiseaux au Canada.
On pense que le déclin du Moqueur roux est lié à la perte et à la dégradation de son habitat, comme c'est le cas pour de nombreuses espèces dépendantes des arbustes. On attribue plus particulièrement la diminution de la qualité de l'habitat disponible à la rotation et la maturation des arbustes et des taillis dans les forêts de l'est, à la perte d’abords de route boisés, des brise-vents et des haies en raison du changement d'utilisation des terres, et à la mécanisation croissante de l'agriculture dans la partie ouest de son aire de répartition (Cavitt et Haas 2000). Le développement et l'urbanisation ont également entraîné la fragmentation et la perte de l'habitat d'hivernage et de reproduction adapté dans son aire de répartition (Cavitt et Haas 2000).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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