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Le Chardonneret jaune se reproduit dans le sud du Canada, de la côte est à la côte ouest. Le Relevé des oiseaux nicheurs indique que les populations au Canada ont peu changées dans l'ensemble depuis 1970 environ, mais que l’espèce a démontré des diminutions au niveau régional, particulièrement dans l’ouest. On pense que le Chardonneret jaune a bénéficié dans quelques régions des modifications apportées au paysage par l'homme. À l'heure actuelle, il y a peu de préoccupations quant à sa conservation.
Comme de nombreux oiseaux chanteurs qui préfèrent les arbustes ou les habitats au stade pionnier, le Chardonneret jaune a profité du défrichement des forêts au profit des terres agricoles et des communautés (McGraw et al. 2009). Cependant, on pense que l'espèce est touchée négativement par la perte d'habitat attribuable à l'intensification agricole et à l'urbanisation, ainsi que par la prédation par les chats domestiques (McGraw et al. 2009).
Environnement et Changement climatique Canada et ses partenaires ont mis au point des Stratégies régionales de conservation des oiseaux dans chacune des Régions de conservation des oiseaux (RCO) au Canada. Dans ces stratégies, une espèce est identifiée comme étant prioritaire pour une ou plusieurs des raisons suivantes :
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